特約醫院或診所對保險病人的處方用藥，每次開給三日份的用量為原則，外用藥一次可開給五日份的用量；但醫師也可視病情的需要，對一般病人最高一次開給七日份的用藥量，對慢性病人一次開給三十日以內的用藥量。 
醫師如果未註明處方不可替代，藥師或藥劑生可以價格不高於原處方藥品，而且同成分、同劑型、同劑量的任何廠牌藥品替代。藥品的處方或替代，要以收載在藥價基準的品項為限。 
醫師可將處方箋交付保險對象到特約藥局調劑，並且可依病情需要，開給慢性病連續處方箋，其適用疾病範圍，由主管機關另訂。慢性病連續處方箋的有效期間最長為三個月，並可分次調劑，每次調劑最多給予  30日以內的用藥量。 
在偏遠地區持有慢性病連續處方箋的保險對象，如果無法到原處方的特約醫療院所調劑，而且所在地區又無特約藥局時，可以依規定到其他特約醫院或衛生所調劑領藥。